Nel corso dei secoli importanti personalità hanno stretti legami con il complesso. Infatti San Tommaso d'Aquino, la cui cella è tutt'oggi visitabile nell'edificio, vi insegnò teologia; mentre tra gli alunni illustri, si ricordano i filosofi Giordano Bruno e Tommaso Campanella.

Negli ultimi anni un restauro su un'area di circa 7mila metri quadrati permette il recupero e riuso di grandi spazi che ospitavano fino agli anno '90 le aule dell'ex Corte d'Assise e le celle di sicurezza.